Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRP12270 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRP12270 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRP12270 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRP12270 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRP12270 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms