Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2AP11388 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms