Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA4P06727 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms