Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTAP01040 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTAP01040 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTAP01040 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms