Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL3O95236 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms