Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCAO15360 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCAO15360 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms