Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms