Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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