Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF879B4DU55 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF879B4DU55 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF879B4DU55 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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