Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms