Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms