Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms