Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms