Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms