Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms