Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN11AQ9UI33 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN11AQ9UI33 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms