Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms