Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms