Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms