Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms