Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS6KB2Q9UBS0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms