Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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