Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms