Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms