Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS2Q9NYR9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKIRAS2Q9NYR9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms