Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms