Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX9Q9NQ69 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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