Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms