Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms