Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms