Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM15Q9C019 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms