Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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