Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms