Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms