Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms