Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms