Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms