Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PIK3R4Q99570 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms