Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms