Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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