Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOLD1Q96LR9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms