Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
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