Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms