Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms