Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms