Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms