Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms