Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms