Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCOLN3Q8TDD5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms