Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PMFBP1Q8TBY8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms